南亚果实蝇染色体水平基因组组装完成

近日，中国农业科学院植物保护研究所农业入侵生物预防与监控创新团队联合国内有关科研单位，首次完成南亚果实蝇染色体水平参考基因组组装，并对其进行了结构和功能注释。该研究填补了南亚果实蝇基因组数据的空白，对了解其遗传学、生态学和进化学具有重要意义，也为南亚果实蝇及其他近缘物种的科学防控提供了数据基础。相关研究结果发表在《科学数据（Scientific Data）》上。

南亚果实蝇是多食性农业害虫，危害多种经济作物，近年来其分布范围不断扩张，对农业生产造成巨大危害。为得到高质量基因组，研究人员首先构建了南亚果实蝇的实验室种群，经过9代近交降低杂合度后，采用单分子测序技术结合染色体构象捕获技术，组装得到421.79兆（Mb）基因组。共鉴定了20922个蛋白质编码基因，其中17251个基因同时被功能注释。经评估，基因组组装完整度为99.7%，注释完整度为97.6%。这一高质量参考基因组将为进一步研究南亚果实蝇的环境适应性和入侵机制提供研究基础。

该研究得到国家重点研发计划等项目的支持。

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